| 車両の所属 | 所属する支社 | 車両数 | 使用区間 | 路線距離 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 新津運輸区 | 新潟支社 | 39両 | 羽越本線 （新津−酒田） | 166.9km | 気動車の運用は14往復程度（新津−酒田間）で、キハ40系、キハ110系、キハE120を使用。他に、電車の運用もある。 |
| 磐越西線−信越本線 （会津若松−新津−新潟） | 90.7km | 1日26往復程度で、キハ40系、キハ110系、キハE120を使用。 | |||
| 米坂線 | 90.7km | 1日12往復程度で、キハ40系、キハE120を使用。 | |||
| 小牛田運輸区 | 仙台支社 | 25両 | 石巻線 | 44.9km | 1日17往復程度 |
| 気仙沼線 | 72.8km | 1日8往復程度 | |||
| 秋田車両センター | 秋田支社 | 52両 | 五能線−奥羽本線 （東能代−弘前・青森） | 153.5km | 以下の2種類の運用がある。 1日17往復程度（東能代−能代間の1駅間列車） 1日17往復程度（路線の大半を占める能代−弘前・青森間） |
| 男鹿線−奥羽本線 （男鹿−秋田） | 39.6km | 1日17往復程度 | |||
| 八戸運輸区 | 盛岡支社 | 38両 | 津軽線 | 55.8km | 気動車の運用は1日8往復程度。他に、電車の運用もある。 |
| 八戸線 | 64.9km | 1日20往復程度 | |||
| 東北本線 （八戸−青森） | 96km | 朝に1往復のみ、キハ40系が八戸−青森間を走る（電化区間なので、ほぼ全ての列車は電車での運用となる）。津軽線用気動車の八戸運輸区への取り込み、および八戸運輸区から津軽線への送り込みが目的で、そのついでに営業運用をしている。2010年に東北新幹線の延伸があり、当区間は青い森鉄道に経営移管される | |||
| 宇都宮運転所 | 水戸支社 | 8両 | 烏山線 | 20.4km | 1日18往復程度 |
| 郡山総合車両センター | 仙台支社 | 18両 | 只見線 | 135.2km | 1日9往復程度（路線の大半を占める小出−西若松間の場合。西若松−会津若松間は会津鉄道が乗り入れており、 列車往来はより頻繁）。 |